Fiji: Procesamiento de imágenes para biotecnología y toxicología

Introducción a Fiji e ImageJ

• Vista general de Fiji y sus aplicaciones en la investigación científica
• Comprensión de la arquitectura de ImageJ y sus complementos (plugins)
• Instalación y configuración de Fiji para un rendimiento óptimo

Técnicas básicas de procesamiento de imágenes

• Adquisición de imágenes y formatos de importación
• Ajuste del contraste, el brillo y aplicación de filtros
• Apilamiento de imágenes y métodos de proyección

Análisis avanzado de imágenes

• Técnicas de segmentación: umbrales y detección de bordes
• Recuento de objetos y análisis de partículas en muestras histológicas
• Medición de áreas, perímetros y otras características morfológicas

Trabajo con muestras biológicas

• Procesamiento de imágenes de tejidos histológicos, células sanguíneas y algas
• Desconvolución de color y análisis de tejidos teñidos
• Análisis de secuencias temporales y seguimiento del movimiento celular

Automatización y personalización

• Creación y ejecución de macros para tareas repetitivas
• Uso de complementos (plugins) de Fiji para análisis especializados
• Scripting básico con el lenguaje de macros de ImageJ (IJM)

Gestión de datos e informes

• Exportación de resultados y generación de informes
• Adición de anotaciones a las imágenes y preparación de datos para su publicación
• Mejores prácticas para un análisis de imágenes reproducible