Fiji: Procesamiento de imágenes para biotecnología y toxicología

Introducción a Fiji e ImageJ

• Descripción general de Fiji y sus aplicaciones en la investigación científica.
• Comprensión de la arquitectura y los complementos de ImageJ.
• Instalación y configuración de Fiji para un rendimiento óptimo.

Técnicas básicas de procesamiento de imágenes

• Formatos de adquisición e importación de imágenes.
• Ajuste del contraste y brillo, y aplicación de filtros.
• Apilamiento (stacking) y métodos de proyección de imágenes.

Análisis avanzado de imágenes

• Técnicas de segmentación: umbralización y detección de bordes.
• Conteo de objetos y análisis de partículas en muestras histológicas.
• Medición de áreas, perímetros y otras características morfológicas.

Trabajo con muestras biológicas

• Procesamiento de imágenes de tejidos histológicos, células sanguíneas y algas.
• Desencomposición del color y análisis de tejidos teñidos.
• Análisis en tiempo real (time-lapse) y seguimiento del movimiento celular.

Automatización y personalización

• Creación y ejecución de macros para tareas repetitivas.
• Uso de complementos (plugins) de Fiji para análisis especializados.
• Programación básica con el Lenguaje de Macros de ImageJ (IJM).

Gestión y presentación de datos

• Exportación de resultados y generación de informes.
• Anotación de imágenes y preparación de datos para publicaciones.
• Mejores prácticas para un análisis de imágenes reproducible.

Resumen y próximos pasos